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Analyse de la diversité des champignons ectomycorhiziens et des

Résumé La diversité morphologique et génétique des champignons ectomycorhiziens et des ectomycorhizes de Coccoloba uvifera a été étudiée le long d’un gradient de salinité (15‰-2‰) sur la plage de Bois Jolan en Guadeloupe. À proximité de l’eau de mer, les arbres sont de petites tailles et rabougris alors que les arbres éloignés sont de plus grandes tailles avec un houppier bien développé sous lequel prolifèrent des plantules issues de graines. Six espèces de sporophores (Amanita arenicola, Inocybe littoralis, Inocybe xerophytica Cantharellus cinnabarinus, Scleroderma bermudense et Russula cremeolilacina) ont été répertoriées en milieu peu salé et seulement une espèce (S. bermudense) en milieu salé. De même, neuf morphotypes ectomycorhiziens (MT), correspondant à six ribotypes, ont été répertoriés en milieu peu salé dont trois en milieu salé. Le polymorphisme de longueur des fragments de restriction et le séquençage de la région ITS de l’ADNr nucléaire ont permis de relier des sporophores aux MT et de montrer que des arbres-mères et leurs plantules ont partagé un cortège ectomycorhizien commun. Quatre sporophores (C. cinnabarinus, I. xerophytica, S. bermudense et R. cremeolilacina) ont été reliés à des MT, deux sporophores (A. arenicola et I. littoralis) étaient absents des racines de C. uvifera et deux MT identifiés (Tomentella sp1 et Tomentella sp2) n’ont pas généré de sporophores. Les arbres-mères et leurs plantules ont eu en commun trois champignons (S. bermudense, Tomentella sp1 et Tomentella sp2) présents en majorité sur leurs racines. Les résultats de cette étude ont montré que (i) la salinité a affecté la diversité des champignons ectomycorhiziens (ii) les sporophores ont été de mauvais indicateurs de diversité (iii) des réseaux ectomycorhiziens potentiels pourraient relier les arbres-mères et leurs plantules. Mots clés : Arbres-mères, Plantules, PCR-RFLP, Séquençage, ITS, Réseaux mycorhiziens communs Abstract : The morphological and molecular diversity of ectomycorrhizal fungi and ectomycorrhizae on Coccoloba uvifera were studied along a salinity gradient ranged from 15‰ to 2‰ at Bois Jolan’s Beach in Guadeloupe. Only mature trees with an abundant seedling recruitement were well developed within areas far from the sea. Six sporocarps (Amanita arenicola, Inocybe littoralis, Inocybe xerophytica, Cantharellus cinnabarinus, Scleroderma bermudense and Russula cremeolilacina) were collected within the low salinity levels, whereas one (S. bermudense) was collected where the salinity levels were high. Similarly, nine morphotypes (MT) of fungi, corresponding to six ribotypes, were sorted in low salinity levels and only three of them in high salinity levels. The restriction fragment length polymorphism and sequencing of the nuclear rDNA ITS region allowed identification of mycobionts in MT by corresponding sporocarp RFLP patterns and sequences. We determined four matched sporocarps (C. cinnabarinus, I. xerophytica, S. bermudense and R. cremeolilacina) with MT, two unmatched sporocarps (A. arenicola and I. littoralis) and two identified MT (Tomentella sp1 et Tomentella sp2) without corresponding sporocarp. Mature trees and seedlings of C. uvifera shared common mycorrhizal networks (CMN) with three fungi (S. bermudense, Tomentella sp1 and Tomentella sp2). The results of this study showed that (i) the salinity decreased the fungal diversity, (ii) the sporocarps were a bad indicator for fungal diversity, (iii) there was a potential for the formation of CMN between mature trees and seedlings. 46 Key words : Mature trees, Seedlings, PCR-RFLP, Sequencing, ITS, Common mycorrhizal networks

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Rubrique: Mémoire/Travaux
Auteur: Raymond AVRIL | rmondo2006@yahoo.fr
Date: 12 Fév 2012